Học Viện Magias Ataraxia Hybrid × Heart kể về Hida Kizuna sở hữu khả năng HHG (Heart Hybrid Gear) nhưng lại không đủ mạnh để trở nên đặc biệt quan trọng. Chị gái của Kizuna đã yêu cầu anh chuyển đến một trường chiến lược quốc phòng, nơi có nhiều sinh viên (trong đó có nhiều cô gái ngực bự) sử dụng HHG của họ để chống lại quân xâm lược từ một thế giới khác trong trang phục phi công mát mẻ đến ngạc nhiên. Khả năng chiến đấu Kizuna không theo kịp được, nhưng chị cậu đã có kế hoạch khác, đó là tìm những cô gái có kinh nghiệm tình ái với Kizuna, để có thể bổ sung năng lượng để tăng sức mạnh.