Nhật Ký Bài Giảng Kỳ Quái Của Thầy Chuzenji kể về Tokyo, 1948, tàn dư chiến tranh và những bí ẩn siêu nhiên trỗi dậy. Kanna, nữ sinh trung học, tìm đến Chuzenji-sensei, giáo viên khó tính, để giải mã những hiện tượng kỳ lạ. Họ cùng nhau dấn thân vào một cuộc phiêu lưu đen tối. Trường học trở thành sân khấu cho những bí ẩn siêu nhiên, nơi sự thật ẩn sau những lời nguyền và bóng tối. Liệu họ có thể vén màn bí mật, hay sẽ bị nuốt chửng bởi những thế lực siêu nhiên?