Thám Tử Thành Phố Fuuto kể về một thời gian sau sự kiện của Kamen Rider W, Shotaro Hidari và Philip tiếp tục giải quyết tội phạm và chống lại cái ác với tư cách là những thám tử siêu anh hùng ở thành phố đầy gió Fuuto.